Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms