Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms