Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxa13Q62424 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms