Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpreP49446 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpreP49446 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpreP49446 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpreP49446 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpreP49446 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpreP49446 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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PtpreP49446 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtpreP49446 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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PtpreP49446 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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