Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp9yF8VPU6 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms