Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms