Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Csmd1Q923L3 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Csmd1Q923L3 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms