Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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ptchd1Q14B62 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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