Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms