Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Hoxd10P28359 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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Hoxd10P28359 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxd10P28359 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms