Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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