Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms