Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms