Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxb2P0C1T1 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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