Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp9yF8VPU6 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms