Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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