Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc18Q640L5 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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