Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Sh3bp2Q06649 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Sh3bp2Q06649 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Sh3bp2Q06649 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp2Q06649 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms