Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd9P28357 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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