Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms