Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Dsg1bQ7TSF1 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms