Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VdrP48281 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VdrP48281 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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