Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Hoxd9P28357 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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