Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
P10404 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
P10404 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms