Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TtrP07309 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms