Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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