Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn16Q925N4 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms