Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim35Q8C006 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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