Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms