Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Usp9yF8VPU6 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Usp9yF8VPU6 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Usp9yF8VPU6 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp9yF8VPU6 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms