Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Trim35Q8C006 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim35Q8C006 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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