Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ubash3bQ8BGG7 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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