Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Rpusd2Q149F1 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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