Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Hoxd10P28359 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms