Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms