Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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