Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm3238W4VSP7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3238W4VSP7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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