Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm17190V9GX38 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17190V9GX38 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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