Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms