Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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