Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms