Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn7Q9Z261 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn7Q9Z261 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms