Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms