Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms