Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Znf394Q9Z1D9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Znf394Q9Z1D9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Znf394Q9Z1D9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Znf394Q9Z1D9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Znf394Q9Z1D9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Znf394Q9Z1D9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Znf394Q9Z1D9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Znf394Q9Z1D9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Znf394Q9Z1D9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Znf394Q9Z1D9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf394Q9Z1D9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms