Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms