Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms