Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms