Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms