Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap4s1Q9WVL1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap4s1Q9WVL1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms